add case-e to website #54
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title: Venkatesh Hariharapura Shivashankar
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affiliation: Institut für Neurowissenschaften und Medizin (INM-7), Forschungszentrum Jülich
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seealso-link: https://www.fz-juelich.de/profile/shivashankar_v
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seealso-text: Persönliches Profil
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sortkey: Hariharapura Shivashankar, Venkatesh
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Research Software Engineer für `case-e`.
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title: Venkatesh Hariharapura Shivashankar
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- datamanagement
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- case-e
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- fzj
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layout: contributor
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orcid: 0009-0005-7032-921X
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affiliation: Institute of Neuroscience and Medicine (INM-7), Research Center Jülich
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seealso-link: https://www.fz-juelich.de/profile/shivashankar_v
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seealso-text: personal profile
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sortkey: Hariharapura Shivashankar, Venkatesh
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Research Software Engineer for `case-e`.
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title: "case-e: Tool zur Verwaltung von Daten aus klinischen Studien"
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contributors:
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- venkatesh-hariharapura-shivashankar
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- juergen-dukart
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- michael-hanke
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`case-e` ist ein Open-Source-System für elektronische Fallberichtformulare (eCRF) zur Konzeption klinischer Studien, zur Verwaltung von Studienabläufen und zur Erfassung strukturierter klinischer Forschungsdaten.
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Klinische Studien erfordern mehr als nur die Datenerfassung. Forschungsteams müssen Protokolle, Teilnehmergruppen, Besuche, Bewertungen und Anforderungen an die Datenerfassung auf eine Weise definieren, die konsistent, behördlich konform und transparent ist. `case-e` ist ein eigenständiges System für elektronische Fallberichtformulare (eCRF), das diese Aufgaben in einem einzigen Arbeitsablauf vereint, den Forscher und Kliniker „out of the box“ einsetzen können. Indem die Datenerfassung anhand eines Studienprotokolls und der darin geplanten Bewertungen organisiert wird, knüpft `case-e` an die übergeordneten Ziele von ABCD-J im Bereich [FAIR-Datenmanagement]({{< relref path="/topics/datamanagement/" lang="de" >}}) an, indem es transparente Arbeitsabläufe von der Studieneinrichtung bis hin zur Datenerfassung und zum Datenexport unterstützt.
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Forscher können Studien von Grund auf neu erstellen oder Vorlagen verwenden. Als konfigurierbare Datenerfassungsplattform mit einem interaktiven Formular-Generator können Teams in wiederverwendbaren und studienspezifischen Datenfeldern festlegen, welche Daten erfasst werden sollen, ohne dass für jede Studie separate Implementierungen erforderlich sind. Die Abstimmung auf standardisierte Ontologien und integrierte Validierungsregeln helfen den Teams dabei, konsistente, vollständige und validierte Daten zu erfassen. Studienkonfigurationen und erfasste Daten werden sicher im Backend-Speicher abgelegt.
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`case-e` wurde als modulare Frontend-Backend-Anwendung entwickelt, bei der Benutzeroberfläche, API und Datenlogik voneinander getrennt sind, um die Wartbarkeit und die Weiterentwicklung zu unterstützen. Die Plattform stützt sich auf [DataLad Concepts](https://concepts.datalad.org/), ein simples aber dennoch expressives Metadatenschema, für die strukturierte Datenerfassung. Die Unterstützung von BIDS-orientierten Exporten kann dabei helfen, Studiendaten für die nachgelagerte Analyse und die Interoperabilität mit Forschungsworkflows vorzubereiten.
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`case-e` steht als gehosteter eCRF-Dienst unter https://ecrf.inm7.de/ für die Nutzung innerhalb der Workflows der ABCD-J-Plattform zur Verfügung. Zudem wird eine Standalone-Version für die lokale oder unabhängige Bereitstellung unterstützt, die über das Repository [`case-e`](https://github.com/Biomarker-Development-at-INM7/case-e) erhältlich ist.
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[{{< icon "document" >}} Docs](https://github.com/Biomarker-Development-at-INM7/case-e) [{{< icon "github" >}} GitHub](https://github.com/Biomarker-Development-at-INM7/case-e)
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content/software/case-e/_index.md
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content/software/case-e/_index.md
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title: "case-e: Clinical Trial Data Management Tool"
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contributors:
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- venkatesh-hariharapura-shivashankar
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- juergen-dukart
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- michael-hanke
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- fzj
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topics:
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- datamanagement
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weight: 2500
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`case-e` is an open-source electronic case report form (eCRF) system for designing clinical trials, managing study workflows, and recording structured clinical research data.
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{{< /lead >}}
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Clinical trials require more than data collection. Research teams need to define protocols, participant groups, visits, assessments, and data collection requirements in ways that are consistent, regulatory-compliant, and transparent. `case-e` is a self-contained electronic case report form (eCRF) system that combines these tasks into one workflow that researchers and clinicians can deploy "out of the box". By organizing data capture around a study protocol and its planned assessments, `case-e` connects with ABCD-J's wider goals of [FAIR data management]({{< relref path="/topics/datamanagement/" lang="en" >}}) by supporting transparent workflows from study setup through to data collection and export.
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Researchers can create studies from scratch or utilize templates. As a configurable data capture platform with an interactive form builder, teams can define what to collect in reusable and study-specific data fields without requiring separate implementations for each study. Alignment with standardized ontologies and built-in validation rules help teams collect consistent, complete, and validated data. Study configurations and recorded data are securely stored in backend storage.
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`case-e` is developed as a modular frontend-backend application, separating the user interface, API, and data logic to support maintainability and further development. The platform draws on [DataLad Concepts](https://concepts.datalad.org/), a simple yet powerful metadata schema, for structured data collection. Its support for BIDS-oriented exports can help prepare study data for downstream analysis and interoperability with research workflows.
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`case-e` is available as a hosted eCRF service at https://ecrf.inm7.de/ for use within ABCD-J platform workflows. It also supports a standalone version for local or independent deployment, available from the [`case-e`](https://github.com/Biomarker-Development-at-INM7/case-e) repository.
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[{{< icon "document" >}} Docs](https://github.com/Biomarker-Development-at-INM7/case-e) [{{< icon "github" >}} GitHub](https://github.com/Biomarker-Development-at-INM7/case-e)
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